荔枝根系因苗木繁殖方法不同而異。實(shí)生樹及嫁接樹有發(fā)達(dá)的主根；高壓（圈枝）繁殖的荔枝側(cè)根須根發(fā)達(dá)，沒有主根。荔枝的根系由很多粗壯發(fā)達(dá)的側(cè)根和纖細(xì)茂密的細(xì)根所組成，初生的幼根白色，肉質(zhì)，質(zhì)脆易斷，俗稱“豆芽根”。老根呈灰褐色。荔枝根系與真菌共生，形成菌根，為總狀分枝式。