10月13日,深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(以下簡稱“基因所”)的最新研究成果,以長篇幅論文的形式在線發(fā)表于權(quán)威學術(shù)期刊《Nature Genetics(自然·遺傳學)》雜志上?;蛩ㄟ^對360份番茄種質(zhì)全基因組的分析,闡明了番茄馴化和育種的基因組學歷史,為番茄生物學研究提供了新的工具,奠定了番茄全基因組設計育種的基礎。這項研究是我國在番茄研究方面繼2012年完成番茄全基因組序列圖的繪制后另一重要成果,極大推進了番茄基因組研究更加深入開展。
據(jù)該研究團隊主要負責人黃三文研究員介紹,番茄起源于南美洲的印地斯山脈,隨著人類遷移經(jīng)由北美洲傳到歐洲,逐漸擴散到世界各地。如今番茄的品種多樣,是世界范圍內(nèi)普遍種植的第一大蔬菜作物,每年全球市場總價值達550億美元。同時,番茄也是植物遺傳、發(fā)育和生理研究的重要模式系統(tǒng)。由于我們?nèi)粘J秤玫拇蠊耘喾咽怯梢吧疡Z化而來的,野生番茄果實非常小,只有1-2克重,經(jīng)過長期的人工馴化,現(xiàn)代栽培番茄的果重是其祖先的100多倍。然而,番茄果實變大的人工馴化過程一直缺乏全面的研究。
因此,基因所借助最新配置的超算平臺進行基因組大數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)番茄果實變大經(jīng)歷了從野生醋栗番茄形成櫻桃番茄,最終成為大果栽培番茄的兩步馴化過程,分別有5個和13個基因受到了人工定向選擇。同時,發(fā)現(xiàn)了加工番茄(主要用于番茄醬加工)的主要基因組特征,闡明了粉果番茄形成的原因。這些研究成果為番茄育種提供了有效的分子工具。
針對該項研究成果,相關專家學者表示:“這項研究真正的意義在于為番茄育種的進一步改良奠定了基礎?,F(xiàn)在我們能夠找到我們關心性狀的關鍵基因。這將很快對番茄育種產(chǎn)生巨大的影響。”
該項成果也是剛剛成立的基因所近期的一項突出成果,位于大鵬新區(qū)的基因所為中國農(nóng)科院和深圳市政府合作建設,是目前國內(nèi)唯一專門從事農(nóng)業(yè)基因組學基礎及應用研究的國家級公益性研究所,旨在利用深圳科技體制機制創(chuàng)新的成功經(jīng)驗,以及中國農(nóng)科院在農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源和品種培育的優(yōu)勢,占據(jù)農(nóng)業(yè)生物科技前沿,推動農(nóng)業(yè)生物經(jīng)濟的發(fā)展。