河北農(nóng)業(yè)大學(xué)教授劉孟軍帶領(lǐng)其棗研究團隊，通過與深圳華大基因科技有限公司等多家單位密切合作，在世界上率先完成了棗樹的全基因組測序。

 

　　棗樹原產(chǎn)于中國黃河中下游地區(qū)，是中國最古老的樹種之一。

 

　　棗樹原產(chǎn)于中國黃河中下游地區(qū)，是中國最古老的樹種之一。據(jù)化石和出土文物考證，棗樹在中國存在已超過1000萬年。中國棗樹的栽培面積和產(chǎn)量均占到世界的99%，且棗樹已被引種到亞洲、非洲、美洲、歐洲和大洋州的40多個國家和地區(qū)。

 

　　基因組測序是打開生物學(xué)奧秘的金鑰匙，同時也是一項非常復(fù)雜的系統(tǒng)工程。2010年，河北農(nóng)業(yè)大學(xué)劉孟軍教授帶領(lǐng)其棗研究團隊，在20多年棗樹科研積淀基礎(chǔ)上，開始了棗樹全基因組測序。

 

　　“在本項目啟動前，有關(guān)棗基因組測序的基礎(chǔ)工作還非常薄弱，甚至連棗的基因組是多大都不知道。”劉孟軍告訴，“棗的基因組屬于高度復(fù)雜的類型，它的雜合度是當(dāng)時利用第二代測序技術(shù)植物中最高的，而且其重復(fù)序列比例偏高，GC含量偏低，使得其測序和組裝難度增大。”

 

　　劉孟軍說，“我們在第二代測序技術(shù)基礎(chǔ)上，采取了PCR-free和BAC-to-BAC等多種技術(shù)措施和方法，有效地克服了高度復(fù)雜棗基因組的測序、組裝以及填圖補洞等一道道難題，最終我們順利完成了我國著名棗品種'冬棗’的全基因組從頭測序，并且獲得了高質(zhì)量的棗基因組序列。

 

　　該研究項目共組裝出438M的序列，占預(yù)估棗基因組大小的98%。同時把80%的序列錨定到了棗的12條假染色體上，注釋出棗基因32000多個。這些基因的獲得為棗后續(xù)的功能基因組學(xué)研究提供了大量的基因資源，為揭示棗特殊生物學(xué)性狀的分子機制奠定了基礎(chǔ)。

 

　　劉孟軍表示，棗全基因組測序的完成，標(biāo)志著中國在棗樹組學(xué)研究方面達到了國際領(lǐng)先水平，一舉跨入了世界果樹基因組學(xué)研究的俱樂部。該成果對推動世界棗功能基因組學(xué)研究、促進棗樹及其他果樹的遺傳改良和分子育種等將產(chǎn)生重大而深遠(yuǎn)的影響，具有重要的學(xué)術(shù)價值和潛在經(jīng)濟價值。