近日,中科院昆明植物研究所完成了亞洲栽培稻(一般稱為水稻)里5個(gè)物種的全基因組測(cè)序,有望進(jìn)一步推動(dòng)水稻品種改良。
在水稻與其他約23個(gè)物種共同組成的稻屬植物中,它和7個(gè)稻種都是AA基因組類型,這些水稻近緣物種間斷分布于亞洲、非洲、澳洲和南美洲的熱帶與亞熱帶地區(qū)。由于與水稻有著密切的親緣關(guān)系,它們蘊(yùn)藏著相當(dāng)多人類尚未認(rèn)識(shí)與利用的優(yōu)異基因。
中科院昆明植物研究所高立志研究員帶領(lǐng)的植物種質(zhì)資源、基因組學(xué)與生物信息學(xué)研究團(tuán)隊(duì),自2007年以來(lái)通過(guò)基因組建庫(kù)與測(cè)序關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)技術(shù)的掌握和基因組序列拼接、注釋與分析等生物信息學(xué)平臺(tái)的構(gòu)建,低成本、自主完成了稻屬植物AA-基因組5個(gè)物種(尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻和南方野生稻)核基因組的測(cè)序和拼接,獲得了高質(zhì)量基因組參考序列。