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首款國產(chǎn)分子育種固相基因芯片發(fā)布,驅動種業(yè)創(chuàng)新與糧食安全

   日期:2024-05-17     來源:聚農(nóng)網(wǎng)    作者:jn720    瀏覽:2955    評論:0    

  近期,蘇州拉索生物芯片科技有限公司聯(lián)合北京市農(nóng)林科學院雜交小麥研究所北京小麥種子檢測中心、中國農(nóng)業(yè)大學、西北農(nóng)林科技大學等單位,成功研發(fā)出我國首款具備完全知識產(chǎn)權(涵蓋SNP標記、芯片、試劑及掃描儀)的高密度固相基因芯片——“華麥芯”普通小麥基因分型65K芯片(簡稱“華麥芯65K”)。這一創(chuàng)新成果不僅填補了我國在該技術領域的長期空白,打破了西方國家長達二十余年的技術壟斷,更是實現(xiàn)了關鍵核心技術的自主可控與全面國產(chǎn)化替代。

  拉索生物高密度固相基因芯片

  過去二十多年間,我國基因檢測行業(yè)高度依賴美國illumina和Affymetrix公司的固相芯片產(chǎn)品,高昂的采購成本與技術差距曾一度成為制約國內(nèi)相關產(chǎn)業(yè)發(fā)展的因素,基因檢測成本居高不下,難以直接應用于分子育種相關研究和應用領域。國產(chǎn)高密度固相基因芯片的成功研發(fā),無疑為我國分子育種事業(yè)的飛躍式發(fā)展開啟了新篇章。除了基因芯片,拉索生物還提供包含自研自產(chǎn)的掃描儀、試劑、配套軟件及算法在內(nèi)的一體化解決方案,有力推動了產(chǎn)業(yè)鏈的完善與優(yōu)化。

  拉索生物OmniScan芯片掃描儀

  面對近年來科技快速進步與成本壓力加劇,國內(nèi)基因分型手段迅速發(fā)展,諸如“液相芯片”、“低深度重測序”等低成本、高通量的替代技術嶄露頭角。然而,這些技術均依賴測序完成基因分型,存在著數(shù)據(jù)處理復雜、檢測周期長、實驗結果存在隨機性等問題。當樣本量巨大,或者基因組復雜程度高時,檢測成本也隨之攀升。

  相較之下,固相芯片以固態(tài)基底(如載玻片)上的寡核苷酸探針為基礎,無需依賴測序或其他基因分型技術,即可一次性并行檢測數(shù)十萬至數(shù)百萬個SNP位點,從檢測到數(shù)據(jù)分析,整個過程僅需72小時,且準確率保持在99%以上。對于農(nóng)業(yè)育種來說,提前拿到分型結果意味著能夠更早地進行淘汰選擇,從而節(jié)省大量成本并提高生產(chǎn)效率。

  微珠芯片構造示意圖

  此外,固相基因芯片在檢測靈活性上亦顯現(xiàn)出顯著優(yōu)勢。用戶可根據(jù)需要隨時添加新的檢測位點,無需重新定制新的芯片。

  尤其值得關注的是,固相基因芯片在規(guī)模化檢測時展現(xiàn)出顯著的成本效益。隨著樣本數(shù)量增加,單個樣本的檢測成本呈下降趨勢,經(jīng)濟效益明顯。

  截至目前,蘇州拉索生物芯片公司已獲得13項發(fā)明專利授權、2項實用新型專利授權、1張醫(yī)療器械注冊證,是中國法律體系下,在高密度固相基因芯片研發(fā)和生產(chǎn)領域知識產(chǎn)權布局最完善的公司。其主要供應商立足本土,不受國際環(huán)境波動影響,確保產(chǎn)品穩(wěn)定供應。專業(yè)的本土技術支持團隊提供全程高效服務,確保用戶無憂使用。

  拉索生物發(fā)明專利證書

  “華麥芯”普通小麥基因分型65K芯片

  華麥芯65K嚴格遵照《小麥品種真實性鑒定SNP標記法》(NY/T 4021-2021),囊括真實性鑒定和已知品種高密度指紋數(shù)據(jù)庫構建的所有位點,并整合轉基因檢測所必需的特定標記物,以及部分與小麥產(chǎn)量、品質、抗病等功能基因或緊密連鎖的SNP標記。以中國春2.1版本為參考,目前包含54993個精選的SNP標記(可根據(jù)未來研究重要結果擴充至65K),覆蓋196個性狀相關標記。SNP位點在A、B、D染色體上分布較均衡,多態(tài)性位點占比高達99.1%,具備良好的區(qū)分能力和穩(wěn)定性;單個SNP位點采用15-30個微球重復檢測,平均檢出率高達99.0%,再現(xiàn)性高達99.5%。

  華麥芯65K實物圖

  結合國產(chǎn)高密度固相基因芯片制備技術,華麥芯65K具備以下顯著優(yōu)勢:

  全自主:從芯片制備到掃描儀、試劑、配套軟件及算法在內(nèi)的一體化解決方案均可自主實現(xiàn)。

  可擴充:可根據(jù)需要在原有芯片基礎上隨時添加新的檢測位點,無需重新定制新的芯片,靈活性高、可塑性強。

  多效用:該芯片集背景篩選、品種鑒定、轉基因檢測等多用途于一體,可實現(xiàn)一站式全面篩查,大幅提高檢測效率,并節(jié)約成本。

  低成本:固相芯片在規(guī)模化檢測時展現(xiàn)出顯著的成本效益。隨著樣本數(shù)量增加,單個樣本的檢測成本呈下降趨勢,經(jīng)濟效益明顯。

  高效率:固相芯片以固態(tài)基底上的寡核苷酸探針為基礎,無需依賴測序或其他基因分型技術,即可一次性并行檢測數(shù)十萬至數(shù)百萬個SNP位點,從檢測到數(shù)據(jù)分析,整個過程僅需72小時,且準確率保持在99%以上。同時,僅需24個樣本即可完成檢測,無需湊樣。

  芯片可廣泛應用于:小麥品種真實性/特異性/一致性輔助檢測,實質派生品種診斷,轉基因檢測,遺傳連鎖圖譜構建與QTL定位,全基因組選擇育種,標記輔助選擇育種等。

  華麥“芯”普通小麥基因分型65K芯片的誕生,不僅為我國小麥育種工作提供了強大工具,更預示著我國固相基因芯片技術將在更多農(nóng)作物種類及研究領域展現(xiàn)出巨大潛力。未來,拉索生物將持續(xù)聚焦玉米、大豆等主糧作物,以及生豬、肉雞、奶牛等多元化農(nóng)業(yè)領域的育種技術革新,推動我國農(nóng)業(yè)向更高效率、更高精度、更高自主性的方向大步邁進。

  每一輪技術創(chuàng)新都有可能觸發(fā)農(nóng)業(yè)革命,每一顆優(yōu)質的種子都蘊含著豐產(chǎn)的希望。拉索生物正以實際行動踐行“通過國產(chǎn)自主研發(fā)和持續(xù)創(chuàng)新,推動基因檢測技術在更多場景的應用和普及”的宏偉愿景,為我國乃至全球的糧食安全與農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化進程貢獻力量。

  欲知詳情,可通過以下聯(lián)系方式咨詢:

  電話:181 5110 5055(微信同號)

  郵箱:sales@lasobiotech.com

  官網(wǎng):https://lasobiotech.com/breeding

  本芯片設計研發(fā)團隊介紹:

  關于蘇州拉索生物

  蘇州拉索生物芯片科技有限公司是國內(nèi)較早實現(xiàn)高密度固相基因芯片技術自主研發(fā)、生產(chǎn)和商業(yè)化的企業(yè)。公司提供包含芯片、掃描設備、試劑、專業(yè)算法及配套軟件在內(nèi)的一站式固相基因芯片解決方案,致力于通過國產(chǎn)自主研發(fā)和持續(xù)創(chuàng)新,推動基因檢測技術在更多場景的應用和普及。

  團隊核心成員畢業(yè)于北京大學、清華大學、哥倫比亞大學、上海交通大學等國內(nèi)外知名學府,并曾在國際一流實驗室或研究中心進行深入研修。研發(fā)團隊成員的專業(yè)背景覆蓋分子生物學、合成生物學、有機化學、機械工程、機器學習、生物信息等多個學科,形成了一個高度專業(yè)且跨學科交融的知識架構。他們在分子診斷、生命科學等領域具有豐富的研發(fā)經(jīng)驗,并同時兼具扎實的項目管理能力和實戰(zhàn)能力。

  關于北京市農(nóng)林科學院雜交小麥研究所北京小麥種子檢測中心:

  北京市農(nóng)林科學院雜交小麥研究所北京小麥種子檢測中心,是從事小麥等農(nóng)作物DNA指紋檢測技術研發(fā)和應用的專業(yè)機構。該中心是農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)作物DNA指紋創(chuàng)新利用重點實驗室(部省共建),首批全國打假維權種子檢測機構之一,小麥等農(nóng)作物種子質量監(jiān)督抽查檢驗、國家及各省市小麥區(qū)試品種DNA指紋檢測牽頭機構,以及農(nóng)作物DNA指紋數(shù)據(jù)庫構建單位。

  團隊現(xiàn)有骨干成員11名,其中正高級2人、副高級1人、中級5人、初級1人,具有博士學位3人、碩士學位4人。團隊承擔國家區(qū)試標準樣品庫和北京麥類種質資源庫建設,擁有各類種質資源約20000余份;率先制定了小麥真實性、品種純度等7套小麥品種分子鑒定標準;構建了我國最大的SSR和SNP-DNA指紋數(shù)據(jù)庫,庫容達1.3萬余份;搭建起農(nóng)作物規(guī)?;疭SR、SNP標記分子鑒定平臺;開發(fā)出wheat90KSNP固相、5K靶向測序液相SNP芯片、65K SNP固相芯片(首個國產(chǎn)具有完全知識產(chǎn)權的SNP芯片);建立了集農(nóng)作物實體庫、表型庫、分子指紋于一體的綜合數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng);累計為品種管理部門和公安司法等提供技術服務3萬余次,為我國小麥種質資源評價、品種選育、品種審定、新品種保護、市場監(jiān)管和種子認證等提供了重要技術支撐。

 
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